V doktorandskom štúdiu ústav garantuje doktorandský študijný program Analytická chémia. Doktorandské štúdium analytickej chémie je zamerané na vývoj nových a pokročilých analytických metód a postupov a teoretických prístupov v oblasti moderných a novodobých separácií látok, elektroanalytických a spektroskopických metód analýzy, chemometrie a všeobecných aspektov analytickej chémie. Absolvent postgraduálneho štúdia je odborníkom v analytickej chémii, ktorý ovláda metódy vedeckej práce a tvorivo pristupuje k vývoju analytických metód.
Absolvent PhD. štúdia ovláda metodológiu vedeckej práce, najmä so zameraním na metodicky orientované oblasti (separačné metódy, identifikačné a detekčné metódy, elektroanalytické metódy, spektrometrické metódy, metódy štruktúrnej analýzy a pod.), špecifické oblasti analytickej chémie (stopová a ultrastopová analýza, analýza komplexných multikomponentných vzoriek, analýza chirálnych zlúčenín) ako aj aplikačne orientované oblasti (bezpečnosť a kvalita potravín, environmentálna analýza, klinická analýza, farmaceutická analýza a pod.).
